不同等级菌种的制作方式有所不同。
菌种制备分为母种（一级菌种）、原种（二级菌种）及栽培种（三级菌种）三级体系，母种培养基以土豆、琼脂为主，原种多采用木屑、玉米芯等混合配方，高压灭菌可有效控制污染。栽培方式包括生料、发酵料及熟料三种，其中发酵料能改善理化性质并杀菌，覆土栽培可调节微生物环境以提升产量与抗病性。培养料以木质素、纤维素为主，需添加氮源及微量元素。
一、平菇菌种怎么制作
1、一级菌种
（1）先将土豆切成小块并放入烧杯里煮半个多小时，然后过滤出里面的水备用。
（2）将琼脂放入煮过土豆的水中，然后将水烧开，琼脂完全溶化后再煮一段时间，之后把汁液分放到试管中，再放到高压锅内消毒杀菌。经过消毒后，将试管斜放，直到冷凉凝固后准备接种。
（3）将品相优良的嫩蘑菇用酒精清洗杀菌，并在无菌箱里切成小块，然后将其接种到琼脂基质上，需注意接种时下面要放一个酒精灯，试管口要在酒精灯上方，尽可能确保接种空间无菌。
（4）用塞子堵上口，再将琼脂基质放入培养箱中进行培养即可，待长满菌丝后就能备用，可形成一级菌种。
2、二级菌种
（1）将大豆等谷粒煮熟（高温杀菌），然后置于无菌的条件下晾干。
（2）玻璃瓶经高温杀菌后放入晾好的谷粒，并封口。
（3）将玻璃瓶放到高压锅内用高压进行灭菌，取出后放在无菌室冷凉。
（4）将培养瓶放到无菌箱里，再将一级菌种放进去，然后用专用的小匙挖出黄豆大小的菌种接种入玻璃瓶内，注意接种时下面要放一个酒精灯，试管口要在酒精灯上方，尽可能确保接种空间无菌。
（5）接种后随即封口，最后将玻璃瓶放到培养室中培养菌种，待长满菌丝后即可备用。
3、三级菌种（生产用菌种）
（1）三级菌种的制备方式与二级菌种的制备方法基本相同，只是培养基通常采用煮熟的玉米粒、麦粒、棉籽等物质。
（2）待三级菌种的菌丝长满后即可取出来种蘑菇。经历了三级菌种的培育后，平菇菌便已完全制作完成。
二、平菇菌棒生长缓慢怎么办
1、选种要慎重
（1）平菇的栽培品种，根据子实体对温度的适应性可大致分为高温型、中温型、广温型、低温型4种。
（2）如果在栽培时品种选择不当，就会出现出菇迟、甚至不出菇的情况。所以，对于平菇的栽培，要根据出菇季节以当地气候合理选择适宜的品种。
2、选择优良菌种
（1）平菇的菌种是指平菇菌丝的纯培养物，可分为母种、原种、栽培种等，菌种不可出现品种混杂、菌种不纯、杂菌污染的情况，否则就会导致平菇不出菇和出菇缓慢的情况发生。
（2）所以农户在生产中一定要选择优良菌种，以确保菌种的纯度，以免出现菌种污染而有些到平菇的栽培效益，造成经济损失。
3、出菇管理
（1）在平菇出菇时要注意几点，首先是要保持菇棚通风畅通，如果通风不畅、温室大棚内二氧化碳浓度较强、空气流动性差时，都会引发子实体生长慢、长势不良等情况。
（2）再就是要调控好温度，要根据平菇品种的类型对出菇温度的要求，调节出菇棚的温度，尽量满足子实体对温度的需求。
（3）最后就是要确保湿度，平菇子实体发育需要潮湿的环境，湿度要求为75%～95%，湿度不合适也会发生子实体生长缓慢或不正常。
