生物肥料通过微生物的生命活动改善土壤环境，主要通过固定空气中的氮素、促进养分转化、增强作物养分吸收、分泌激素刺激根系生长以及抑制有害微生物，从而促进作物生长。
生物肥料通过增加土壤中的氮源，分解难溶的磷和钾，转化为作物可吸收的养分，从而改善土壤肥力，促进作物生长。
生物肥料通过固定空气中的氮素、产生生长激素、增强作物抗病抗旱能力，促进作物对营养物质的吸收。
一、生物肥料的作用机理
1、生物肥料本身并不含有作物生长所需要的营养元素，它主要是通过自身微生物生命活动，改善作物营养条件。比如固定空气中的氮素，参与养分转化，促进作物对养分吸收，分泌各种激素刺激作物根系发育，抑制有害微生物活动等，微生物肥料主要是通过这些达到促进作物生长的目的。
2、生物肥料主要是增进土壤肥力，增加土壤中的氮素来源，而且还可以将土壤中难溶的磷、分解出来，转变为作物能吸收利用的磷、钾化合物，改善作物的营养条件。
3、生物肥料可以帮助农作物吸收营养根瘤菌，以防侵染豆科植物根部，固定空气中的氮素。微生物在繁殖中能产生大量的植物生长激素，这些激素可以刺激和调节作物生长，使植株生长健壮，促进作物对营养元素的吸收。
4、生物肥料还可以增强植物抗病和抗旱能力，生物肥料因为在作物根部会大量生长繁殖，这样就能抑制或减少病原微生物繁殖机会。生物肥料还有抗E物的作用，减轻作物的病害，微生物大量生长，菌丝能增加对水分的吸收，使作物抗早能力提高。
二、生物肥料的施用技术
1、拌种：先将种子表面用水喷潮湿，然后将种子放入菌肥中进行曲搅拌即可，一定要使种子表面均匀粘满菌肥，这样才可以播种。
2、育秧：进行床式或盘式育苗时，可将菌肥拌入育苗土中堆置3天，然后再做成苗床或装入育苗盘。营养钵育苗时，可以先将肥料拌入营养土中，再做成营养钵。
3、穴施：先将菌肥与湿润的细土拌均匀，然后将其施在移栽或插秧的穴内，最后直接移栽幼苗或插秧覆土即可。
三、生物肥料有哪些
生物肥料按种类分主要有：秸秆腐熟剂、畜禽粪便和有机垃圾发酵剂、微生物接种剂、光合细菌肥料、复合微生物肥料、“酵素菌”和“EM ”、乳酸菌有机肥、生物有机肥料等。
