害处一：使作物无法正常呼吸，干物质的消耗量超过积累量，导致繁殖器官早熟，籽粒不饱满，降低产量。
害处二：磷酸钙使用过多，锌与磷产生作用会形成磷酸锌沉淀，而作物无法吸收这种物质，最终会缺锌。碱性磷肥使用过多，土壤会变碱，使作物无法正常吸收锌元素。
害处三：固定土壤中的硅元素，导致作物缺硅。如果种植喜硅作物，茎秆会变得纤细，容易倒伏、发生病害。
一、过量使用磷肥的害处
1、害处一
过多的磷素营养会促使作物呼吸作用过于旺盛，消耗的干物质大于积累的干物质，造成繁殖器官提前发育，引起作物过早成熟，籽粒小，产量低。
2、害处二
过量施用磷酸钙后，会使土壤里的锌与过量的磷作用，产生磷酸锌沉淀，作物没有办法吸收，使作物出现明显缺锌症状；过量施用钙镁磷肥等碱性磷肥后，会使土壤碱化，使锌的有效性降低，影响作物对锌的吸收。
3、害处三
据研究，过量施用磷肥后，还会造成土壤中的硅被固定，不可吸收，引起作物缺硅，特别是对喜硅的禾本科作物的影响更大。如喜硅作物水稻，若不能从土壤中吸收到较多的硅元素就会发生茎秆纤细，倒伏及抗病能力差等缺硅症状。
4、害处四
适量施用磷肥，会促成作物对钼的吸收，但过量施用磷肥，却会使磷和钼失去营养平衡，影响作物对钼的吸收，表现出“缺钼症”。
5、害处五
磷肥主要来源于磷矿石，磷矿石中含有许多杂质。其中包含镉、铅、氟等有害元素。而且施用磷肥会引起土壤中镉的增加，其年增长量分别为0.15％和0.08％，且这种镉有效性高，易为作物吸收，给人畜造成危害。
6、害处六
过磷酸钙含有大量的游离酸，连续大量施用，会造成土壤酸化。钙镁磷肥含有25%-30%的石灰。大量施用会使土壤碱性加重和理化性质恶化。
二、怎么确定磷肥的施用量
1、根据土壤供磷能力，掌握合理的磷肥用量
（1）土壤有效磷的含量是决定磷肥肥效的主要因素。通常土壤有效磷（P）小于5mg/kg时，为严重缺磷，氮磷肥施用比例应为1：1左右。
（2）有效磷（P）含量在5-10mg/kg时，为缺磷，氮磷肥施用比例在1：0.5左右。
（3）有效磷（P）含量在10-15mg/kg时，为轻度缺磷，可以少施或隔年施用磷肥。
（4）当有效磷（P）含量大于15mg/kg时，视为暂不缺磷，可以暂不施用磷肥。
2、掌握磷肥在作物轮作中的合理分配
（1）在旱地轮作时，因为冬、秋季温度低，土壤磷素释放少，而夏季温度高，土壤磷素释放多。故磷肥应重点用于秋播作物上。
（2）如小麦、玉米轮作时，磷肥主要投入在小麦上作基肥，玉米利用其后效。豆科作物与粮食作物轮作时，磷肥重施于豆科作物上，以促进其固氮作用，达到以磷增氮的目的。
3、注意施用方式
（1）磷肥施入土壤后易被土壤固定，且磷肥在土壤中的移动性差，这些都是导致磷肥当季利用率低的原因。
（2）为提高其肥效，旱地可用开沟条施、穴施；水田可用蘸根等集中施用的方法。同时注意在作基施时上下分层施用，以满足作物苗期和中后期对磷的需求。
4、搭配施用有机肥、氮肥、钾肥等
与有机肥堆沤后再施用，能显著地提高磷肥的肥效。但与氮肥、钾肥等配合施用时，应掌握合理的配比，具体比例要根据对土壤中氮、磷、钾等养分的化验结果及作物的种类确定。
