1、蔬菜连作后，有益微生物繁殖受到抑制，而有害微生物大量繁殖，再加上病菌、虫卵的连年累积，从而导致病虫害加重。
2、蔬菜连作会加重土壤次生盐渍化程度以及酸化程度。
3、蔬菜连作会导致土壤中的有毒物质积累，进而对蔬菜作物造成毒害。
4、蔬菜连作会导致土壤营养元素失衡，进而影响蔬菜生长。
一、蔬菜连作的危害
1、病虫害加重
（1）设施连作后，因为其土壤理化性质以及光照、温湿度、气体的变化，一些有益微生物（铵化菌、硝化菌等）生长受到抑制，而一些有害微生物迅速得到繁殖，土壤微生物的自然平衡遭到破坏。
（2）这样不仅导致肥料分解过程的障碍，而且病虫害发生多、蔓延快，且逐年加重，特别是一些常见的叶霉病、灰霉病、霜霉病、根腐病、枯萎病和白粉虱、蚜虫、斑潜蝇等基本无越冬现象，从而使生产者只能靠加大药量和频繁用药来控制，造成对环境和农产品的严重污染。
2、土壤次生盐渍化及酸化
（1）设施栽培施药量大，加上常年覆盖改变了自然状态下的水分平衡，土壤长期得不到雨水淋浇。再加上温度较高、土壤水分蒸发量大，下层土壤中的肥料和其他盐分会随着深层土壤水分的蒸发，沿土壤毛细管上升，终在土壤表面形成一薄层白色盐分即土壤次生盐渍化现象。
（2）同时由于过量施用化学肥料，有机肥施用又偏少，土壤的缓冲能力和离子平衡能力遭到破坏而导致土壤PH值下降，即土壤酸化现象。造成土壤溶液浓度增加使土壤的渗透势加大，农作物种子的发芽、根系的吸水吸肥均不可正常进行。
3、植物自毒物质的积累
这是一种发生在种内的生长抑制作用，连作条件下土壤生态环境对植物生长有非常大的影响，尤其时植物残体与病原物的代谢产物对植物有致毒作用，并连同植物根系分泌的自毒物质一起影响植株代谢，导致自毒作用的发生。
4、元素平衡破坏
（1）因为蔬菜对土壤养分吸收的选择性，某些元素过度缺乏，而某些元素又过多剩余积累，单一茬口易使土壤中矿质元素的平衡状态遭到破坏。
（2）营养元素之间的拮抗作用常影响到蔬菜对某些元素的吸收，容易出现缺素症状，终使生育受阻，产量和品质下降。
二、怎么预防蔬菜连作
1、蔬菜品种间实行轮作，也就是不同蔬菜品种间进行轮作种植3-5年。
2、播种前或移栽前实施土壤，杜绝土传病虫害发生。
3、合理施肥：采取测土配方平衡施肥，调节土壤营养，以施有机肥为主，有机肥和无机肥相结合，不偏施氮肥，做到科学施肥。
4、清洁田园，不乱扔病叶、病株，病叶和病株集中带出田外统一烧毁，可降低病虫害基数。
5、在灌溉时避免田水串灌，可防止病虫浸入危害。
